芡实主要病害有叶斑病和叶瘤病。
一、芡实叶斑病
真菌性病害。多在开花结果期发生，病菌孢子靠水流、气流和风雨传播。在叶片上产生多数圆形斑点，由暗绿转深褐色，潮湿天气长出灰色霉层，严重时全叶腐烂。
防治方法：
增施磷、钾肥；发病初期，用70%的甲基托布津800~1000稀释液和25%的多菌灵500倍稀释液喷雾防治，交替使用，每周一次，共2~3次。
二、芡实叶瘤病
真菌性病害。多在夏秋多雨季节发生。先在叶面上出现黄斑，继而凸起呈瘤状，上有红纹，使叶受累下沉，芡花不能出水开放，影响结果，造成减产。
防治方法：
增施磷、钾肥；发病初期，用70%的甲基托布津50克加磷酸二氢钾100克，加水40~50千克稀释均匀，对芡叶喷雾，每5~7天一次，共2~3次。
主要虫害有莲食根金花虫、蚜虫、菱萤叶虫甲等。发生情况、危害及防治防治方法参照菱的病虫害防治。
