唐菖蒲发生的主要病害有弯孢霉叶斑病、枯萎病、锈病、细菌性病害、线虫病、青霉病等。以弯孢霉叶斑病、细菌性病害为害严重。
1.弯孢霉叶斑病
（1）症状特征：叶片被病菌侵染后，初生角状斑，后沿叶脉扩展呈长椭圆形黄褐色病斑，边缘红褐色，外围有黄绿色晕圈，中央有黑褐色霉层。该菌还为害花和球茎。花感病后，产生不规则的圆形至椭圆形黄褐色病斑，后期变褐色。球茎上感病后，生浅色至黑色小病斑，可使球茎中心呈褐色软木质状腐烂。
（2）防治方法
①种植唐菖蒲的花田应进行以3年以上的轮作为宜。
②球茎或种子消毒处理。将去壳的种子放入0.05％～0.1％洗涤剂57℃的热溶液中浸泡10分钟，或将球茎在50％多菌灵可湿性粉剂1000倍液中处理10～15分钟。
③发病初期，喷施70％代森锰锌可湿粉剂500倍液或40％百菌清悬浮剂500倍液、15％亚胺唑可湿性粉剂500倍液、40％氟硅唑乳油7000～8000倍液。10天1次，防2～3次。
2.细菌性病害
（1）症状特征：该病为唐菖蒲的常见病害。染病后，引起球茎疮痂、叶斑和茎腐。球茎疮痂呈褐色凹陷，圆形病斑边缘凸起。叶片染病产生红褐色小斑。湿度大时，斑点合并扩大成长形坏死斑。有时在叶脉间引起深色水渍状长方形病斑。病斑干燥后，成淡褐色并有漆状的细菌溢泌物。
（2）防治方法
①采取无病种球繁殖花苗，及时拔除病株。浇水时仅限根际，不要淋湿叶片，以免引发病害。
②栽植采用3％米乐尔颗粒剂处理土壤，按亩散施3～5千克于土表。
③发病初期喷72％农用链霉素4000倍液。
