按照“预防为主，综合治理”的原则，针对不同的病虫危害，及时对症下药，进行消灭，确保幼苗健康生长。特别要预防日灼、立枯病和猝倒病。从出苗期到苗木木质化这段时间内，要交替使用波尔多液和FeSO4进行预防，19%的波尔多液每周喷洒两次，0.5%的FeSO4每周喷洒1次，如果严重时可连续使用波尔多液1周，每天喷洒1次。每次喷药完毕要及时喷水冲洗，以防发生药害。喷药时间也很重要，以每天上午10点以前，下午4点以后最佳。
除草最好在漫灌后进行。按照“除早、除小、除了”的原则，保持容器内、床面和步道无杂草。除草时一定要小心细致，草离苗近时，将苗的周围按住，将草缓慢拔起，确保幼苗不受伤害。拔出的杂草要清理出苗圃，病株要集中烧毁，以防病害蔓延。白皮松幼苗抗寒能力较差，为使当年生的白皮松幼苗能安全越冬，于11月中旬浇封冻水，并对白皮松幼苗进行埋土防寒，次年春撤除防寒土后及时浇解冻水。
