北京小菊从母株采芽、扦插、成苗到开花，整个生长发育期，都有虫害的发生。危害较为严重的主要有蓟马、菊姬蚜、菊天牛和菊瘿蚊四种。
一、蓟马
蓟马危害菊花、月季等50多种花卉，同时能危害萝卜和大白菜。以若虫和成虫吮吸花的汁液，在春季危害北京小菊母株和扦插苗，叶片受害的凹凸不平，有银白、黑褐色花斑。发生严重时叶片变黄，影响生长和发育。蓟马一年发生数代，以雌成虫在菊花茎部和松散土层越冬。3月份菊花母株发芽后，成虫开始活动、产卵，以若虫危害菊花母株嫩叶。据1997年调查，3月中下旬大量若虫开始危害北京小菊母株和扦插苗，应及时防治，否则防治不及时，严重影响菊花前期生长。
防治办法：
1、改变生态环境，减少蓟马的发生。月季和菊花不要间作栽培，盆栽月季和盆栽菊花不要混摆，否则都有利于蓟马发生，特别是秋季间作萝卜或白菜，翌年蓟马发生严重。
2、若虫发生期可喷40%氧化乐果1000倍。
3、大棚越冬菊花母株区，可埋施15%铁灭克，每亩施1至1.5公斤，结合灌水，杀死越冬蓟马。
二、菊姬蚜
北京地区主要危害菊、野菊和泥胡菜。北京地区一年发生10多代，以无翅雌蚜在母株叶腋和泥胡菜上越冬，北京小菊因发芽早，受害严重。时间在4月下旬至5月上旬为繁殖和危害高峰期。主要分布在芽、嫩稍和叶片上吸吮汁液。被害嫩稍卷曲，不但影响植株生长，而且由于蚜虫排泄蜜露，易发生煤污病，还能传播病毒。5月份干旱少雨，天敌受抑制，有利于蚜虫发生。
防治方法：
1、清除北京小菊母株区杂草，特别是泥胡菜，减少菊姬蚜的越冬寄主。
2、保护天敌，主要有瓢虫和食蚜蝇，喷植物农药护卫鸟1000倍或15%蓖麻油烟碱乳油800-1000倍药液防治。
3、发生特别严重地块可喷40%氧化乐果1000倍及菊杀乳油2000倍药液防治。
三、菊天牛
菊天牛主要危害菊花、野菊和艾蒿，北京小菊受害最重。据调查，最近几年菊天牛时有发生，但未引起人们注意和重视，菊天牛的发生在北京地区正在迅速扩散和蔓延。 菊天牛在北京地区一年发生一代，以成虫在小菊或艾蒿根际附近越冬，翌年4月上旬 开始活动，一直到5月中下旬，发生高峰期在5月上旬。成虫有假死性。5月上旬孵化幼 虫，幼虫先在原处啃食，再向下蛀食，9月份化蛹，10月羽化成为成虫越冬。 北京小菊露地栽培年限越长，越冬虫源基数越多，小菊发芽越早，受害就越严重，4 月下旬至5月上旬阴天多雨有利于成虫活动、交尾、产卵、孵化和危害。
防治方法：
1、消灭越冬寄主，减少害虫越冬基数。在北京小菊母株区清除寄主艾蒿，露地栽培超过3年就更新。在根际处施内吸性杀虫剂。
2、4月下旬至5月上旬，以40%氧化乐果800倍药液喷雾。防治时间在上午，一般喷2 至3次药即可。在母株区也可采用人工捕捉。防治卵和幼虫，发现嫩稍萎蔫要及时剪掉深埋，也可用40%甲基异硫磷1500倍灌根。
四、菊瘿蚊
菊瘿蚊是近几年发生较重的一种害虫，主要危害小菊的顶端，叶腋的嫩芽，形成虫瘿， 受害严重时虫株率达90%以上。虫瘿能破坏顶芽和侧芽的营养和生殖生长，严重影响花蕾的形成，对茶花的生产造成极大的威胁，降低菊花的观赏价值。北京地区一年发生3至4代，以幼虫在土内越冬，翌年4月上中旬出现成虫，5月上旬出现大量虫瘿，5月中旬化蛹。第二代虫瘿大量出现在8月。第三代在9月上旬，10月份幼虫入土过冬。因每年气候条件不同，发生时轻时重，特别是5至6月份天气少雨发生就轻，多雨有利于瘿蚊的发生。
防治方法：
1、减少越冬基数和越冬场所，清除残株，特别是露地栽植小菊3年以上应该更新。
2、采摘虫瘿，特别是越冬代虫瘿出现后应及时采摘烧毁。
3、菊花生长季节初见虫瘿，在根部灌浇40%氧化乐果1000倍或甲基异硫磷1500倍药
